人类与传染病奋战的公卫史上，天花的戏剧性数一数二。 英国医师爱德华．詹纳（Edward Jenner）在 18 世纪末发明牛痘 ，也让人类认识了一种有效预防疾病的方式。尽管如此，天花在 20 世纪仍然夺走 300 到 500 万人的性命。
尔后全人类团结一致对抗天花，不可思议地成功了！ 世界卫生组织在公元 1980 年宣布野生的天花绝迹──那一年谭德塞 15 岁，WHO 达成最伟大的成就之一。
全球天花根除计画（Global Smallpox Eradication Program）的前后 3 任领导： J. Donald Millar、 William H. Foege、J. Michael Lane 博士，1980 年时拍摄。取自 wiki找到 1400 年前的天花，比维京人更古老
天花是人类古老的传染病，如埃及法老拉美西斯五世，公元前 1154 年可能就是亡于天花。但是其他疾病也会产生类似天花的症状，使得古代疑似天花的病例难以判断。
近来由遗骸中取得 DNA 的研究大行其道，不少研究者也借此探讨古代的微生物。最近发表的论文报告，在欧洲北部 7 到 11 世纪（涵盖维京时期），11 人的遗骸中发现天花病毒，表示至少在那个时候已经有人感染天花。1, 2, 3
天花病毒（variola virus，缩写为 VARV）是 DNA 病毒。新发表的论文由年代介于距今 150 到 36000 年前，欧亚大陆和美洲的 1867 个古代样本中搜寻天花，结果在 26 个样本中侦测到天花病毒的碎片。
古代天花病毒的取样地点。KHA1 和 FIN1 年代为 19 世纪，VD21 为 17 世纪，其余 11 个样本介于 7 到 11 世纪。取自 ref 1进一步分析，这 26 个样本中有 13 人的结果比较可靠，从中取得比较大量的病毒 DNA 片段。出土于俄罗斯西部的 2 人年代为 19 世纪；其他 11 人年代介于公元 603 到 1050 年，分别位于北欧、不列颠、俄罗斯西部 ，从中拼凑出 4 个完整的基因组，平均覆蓋率介于 5.01 到 45.19。
介绍这次发现时，包括论文和一些新闻，都写说得知「维京时期（Viking Age）」的天花。肯定曾有维京人感染天花，不过严格来说，维京时期在公元 793 年才正式开始；年代在此之前的样本，都早于维京时期。
失传的古代天花
天花是正痘病毒（Orthopoxvirus）旗下一员。将已知的天花及其近亲，如牛痘病毒（vaccinia virus）、骆驼痘病毒（camelpox virus）共 84 个样本摆在一起，建构出的演化树显示：这回找到的所有古代天花自成一群，与现代天花的 共同祖先能追溯到 1700 年前左右 。
天花与近亲们的亲戚关系，这回获得的古代样本（aVARV，红色样本）自成一群，和现代天花（mVARV）分属不同演化分枝。取自 ref 1之前有论文报告，在 300 多年前的立陶宛样本中发现天花（VD21），和现代病毒的共同祖先约为 400 多年前，因而质疑天花的历史是否真的那么悠久，更早以前，如埃及法老等疑似天花的记载或遗骸病理研究，是否为其他疾病所致。新发表的论文则证实，年代更早的天花的确存在，只是其演化支系在某个时候失传了。4
不只天花，之前一系列鼠疫杆菌，以及麻疹的古代DNA 研究，都发现 年代愈接近现代，病原体的遗传多样性也丧失愈多。取得年代愈早的样本，估计病原体的起源时间也会愈早。 光凭数量有限的样本，不足以一口咬定起源时间。
不断失去基因的天花病毒， ... 伤力愈来愈强？
天花一类的正痘病毒们，可以感染不同宿主，引起轻重有别的症状。有些病毒宿主范围较宽，能感染多种对象， ... 伤力却多半不强。宿主种类较少，感染范围较窄的病毒，通常威力也比较强；有意思的是，这群病毒一般也会少掉一些基因。
正痘病毒战队的 ... 伤力是减法，时常是基因变少， ... 伤力变强。（正相关，但是不见得有因果关系）
各天花病毒基因组中，致病基因们的状况；大致上愈接近现在的天花，少掉愈多基因。取自 ref 1过往研究指出， 正痘病毒们有 200 多个基因和致病密切相关。 交叉比对不同种正痘病毒， 感染牛的病毒 cowpox（和用于牛痘接种的那款不同）有 209 个基因， 是近亲中数量最多的。它可能最接近众多正痘病毒尚未分家以前，共同祖先时期原本的状态 ，后来分家为不同病毒，面对各异的宿主后，旗下成员们才各自失去不同基因。
详细分析古代和现代的天花样本，可以发现它们各自失去不同的基因。算总数的话，现代天花的基因数量比古代同类更少；不过也有些古代天花少掉的基因，在现代同类中仍然存在。总之状况非常复杂。
整体看来， 基因丧失与年代呈线性关系，愈接近现代，天花有愈多基因丧失 。假如基因减少的速度和最近 1000 年一致，那么估计在 4000 年前，天花的基因状态类似 cowpox，不过这样估计的误差很大就是了。
不同年代的天花，与致病基因数量的线性关系。取自 ref 1基因和现在不一样，古代的「天花」是天花吗？
这项发现引发一个问题：古时候的天花，是我们所认识的那个天花吗？
我们知道的天花，确诊死亡率约有 30%，即使没死也可能有后遗症，算是 ... 伤力强大的传染病 。感染过天花的几位 7 到 11 世纪古人，由出土状况无法判断是否因天花去世。然而一度存在他们体内，后来某个时刻失传的病毒， 由遗传组成看来， ... 伤力似乎不如现代天花。
假如天花在比较早期的 ... 伤力不如后世，它们是在什么时候变得更致命？这个问题很有意思。 一般来说，传染病如果 ... 伤力太强，反而不利传播 ，像是今年横行世界的 SARS二世冠状病毒（SARS-CoV-2），靠著 ... 伤弱、传播强，使得它的疫情远远胜过 ... 伤强、传播弱的 SARS 和 MERS 两位前辈。
中美洲 1585 年天花疫情的历史纪录。取自 wiki奇妙的是，如果这回研究的古代天花 ... 伤力真的较弱，那么就是较不致命的古代天花灭绝了，更加凶险的现代天花却广传世界。
... 伤力更强的现代天花，传染能力也胜过古代同类吗？被欧洲人带到美洲，横扫美洲原住民的天花又是什么款式？研究传染病演化，这些是非常值得深究的问题。
追寻天花的起源与传播，认识传染病演化
根据已知资讯，仍不足以得知天花的起源地点与年代。不过可以肯定至少在公元 603 年，欧洲北部已经有人感染天花；所以天花 起源自欧亚大陆或非洲某处的时间点，必定更早于 1400 年前。
有些当时的历史文献记载，欧洲南部有人感染天花。假如历史记载属实，意谓当时欧洲各地都有天花存在，而且缺乏文字记录的北部也不例外。不过目前各方面的资讯非常有限，无法评估当时有多流行。
天花演化史上的大事件。取自 ref 3这次调查没有在年代更早，也没有在欧洲北部以外发现感染天花的人，不等于那些时空中没有人得到天花。 不是所有天花感染者的遗骸，都能顺利取得天花病毒的 DNA；也可能古代感染人数太少，所以留下记录的机率太低。
天花在历史上的 ... 伤力可能愈来愈强，WHO 统筹各国之下，天花最终在 1980 年惨遭人类灭团。40 年后，全人类又面临新的 SARS二世冠状病毒威胁，WHO 却不复当年神勇。如今研究天花，除了怀古以外，认识传染病的演化也别具意义。
延伸阅读
本文亦刊载于作者部落格《盲眼的尼安德塔石匠》暨其 ... 同名专页。
SARS SARS-CoV-2 SARS二世 SDGs 目标 3｜健康与社会福利 WHO 世界卫生组织 俄罗斯 传染病 冠状病毒 北欧 古代DNA 天花 天花病毒 宿主 爱德华詹纳 拉美西斯五世 欧洲 正痘病毒 死亡率 演化 演化树 牛痘 维京 维京人 维京时期 麻疹 鼠疫杆菌 yahoo 纽虫 圆周率 雷达 康乃馨
